So với cơ cấu tổ chức bộ máy cũ với 27 đơn vị, bộ máy mới của Bộ GTVT giảm 4 đơn vị, trong đó Tổng tỷ lệ kèo nhà cái bộ Việt Nam được tách ra thành 2 cục (tỷ lệ kèo nhà cái bộ Việt Nam và tỷ lệ kèo nhà cái cao tốc Việt Nam).

Ngoài ra, bộ máy mới của Bộ GTVT cũng không còn Vụ An toàn giao thông, Vụ Quản lý doanh nghiệp, Vụ Đối tác công – tư, tỷ lệ kèo nhà cái Y tế giao thông vận tải.

Bên cạnh đó, Vụ Môi trường được nhập vào Vụ Khoa học Công nghệ thành Vụ Khoa học Công nghệ và Môi trường; tỷ lệ kèo nhà cái Quản lý xây dựng và Chất lượng công trình giao thông đổi tên thành tỷ lệ kèo nhà cái Quản lý đầu tư xây dựng và có thêm Vụ Hợp tác Quốc tế.

Cục Hàng hải Việt Nam, Cục Hàng không Việt Nam, tỷ lệ kèo nhà cái thủy nội địa Việt Nam có các Cảng vụ trong cơ cấu tổ chức của Cục. Các Cảng vụ Hàng không, Cảng vụ Hàng hải và Cảng vụ Đường thủy nội địa là tổ chức hành chính tương đương Chi cục thuộc Cục thuộc bộ.

Bộ trưởng Bộ Giao thông vận tải quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của các tổ chức trực thuộc bộ; trình Thủ tướng ban hành danh sách các tổ chức sự nghiệp công lập trực thuộc bộ.

Nghị định cũng quy định rõ, Vụ Quản lý doanh nghiệp tiếp tục duy trì hoạt động theo quy định hiện hành cho đến khi Bộ Giao thông vận tải hoàn thành việc tái cơ cấu Tổng công ty Công nghiệp tàu thủy theo quyết định của cơ quan có thẩm quyền.

tỷ lệ kèo nhà cái Y tế Giao thông vận tải tiếp tục duy trì hoạt động theo quy định hiện hành cho đến khi Bộ Giao thông vận tải hoàn thành việc bàn giao nguyên trạng các cơ sở y tế thuộc tỷ lệ kèo nhà cái Y tế Giao thông vận tải về địa phương quản lý và Trung tâm Y tế - Môi trường lao động Giao thông vận tải được thành lập theo quy định.

Bộ trưởng GTVT quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của tỷ lệ kèo nhà cái bộ Việt Nam, tỷ lệ kèo nhà cái cao tốc Việt Nam, bảo đảm kế thừa các nhiệm vụ, quyền hạn của Tổng tỷ lệ kèo nhà cái bộ Việt Nam theo quy định của pháp luật và điều ước quốc tế cho đến khi cơ quan có thẩm quyền ban hành hoặc sửa đổi, bổ sung các quy định của pháp luật có liên quan.

Các đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc Tổng tỷ lệ kèo nhà cái bộ Việt Nam tiếp tục duy trì hoạt động theo quy định hiện hành cho đến khi cơ quan có thẩm quyền hoàn thành việc sắp xếp đối với các đơn vị này.

Các Cảng vụ Hàng không, Cảng vụ Hàng hải và Cảng vụ Đường thủy nội địa tiếp tục được áp dụng cơ chế tài chính của đơn vị sự nghiệp công lập theo quy định cho đến khi cơ quan có thẩm quyền quyết định thực hiện cải cách chính sách tiền.

Nghị định này có hiệu lực từ ngày 1/10/2022.